El barco traspasó varias veces la línea de la frontera en el Mar Amarillo, ingresando a áreas que reclama Corea del Sur.
Tras varias advertencias del Ejército surcoreano, volvió a su territorio, indicó el ministerio.
Corea del Sur quiere determinar si el barco violó la frontera intencionalmente, informó la agencia de noticias nacional Yonhap, citando a un portavoz del ministerio.
No se descarta que la embarcación haya violado la frontera durante ejercicios del Ejército norcoreano.
Estados Unidos y Corea del Sur dieron el lunes inicio a los ejercicios militares conjuntos que realizan en forma anual, pese a las protestas de Corea del Norte.