La caída se produjo después de dos días de negociación positivos, con la capitalización bursátil de las empresas en el tablero que alcanzó un máximo de casi dos años el jueves.
Chihiro Ota, gerente general de investigación de inversiones de SMBC Nikko Securities Inc., dijo: "El firme tono del yen ha abollado el sentimiento general".
El dólar estadunidense cayó frente al euro y al yen después de que el presidente del Banco Central Europeo, Mario Draghi, dijo el jueves que el BCE discutirá cuándo recortar su compra masiva de bonos en el otoño.
Los actores del mercado también estaban preocupados por la administración del presidente estadunidense, Donald Trump, tras informes de que el asesor especial Robert Mueller está investigando los negocios de Trump, unas transacciones relacionadas con la supuesta intromisión de Rusia en la campaña presidencial, dijo Ota.
Al cierre de la jornada bursátil, el principal indicador tokiota, el Nikkei de 225 acciones, retrocedió 44.84 puntos (0.22 por ciento), al ubicarse en 20 mil 099.75 unidades.
En tanto, el segundo indicador, el Topix, que agrupa a los valores de la primera sección, bajó 3.02 puntos (0.18 por ciento), para ubicarse en mil 629.99 unidades.
En China, el referencial CSI300 de las principales acciones que cotizan en los mercados de Shanghai y Shenzhen perdió 19.29 puntos, un 0.51 por ciento, al ubicarse en tres mil 728.60 unidades.
El Shanghai Composite Index registró una baja de 6.88 puntos (0.21 por ciento) para cerrar en tres mil 237.98 unidades.
A su vez, el Shenzhen Component descendió 2.16 puntos (0.02 por ciento) para ubicarse en 10 mil 364.82 unidades, informó la agencia Xinhua.